Riecht es im Humidor nicht nach Tabak, sondern muffig oder gar-schimmlig, so kommen dafür verschiedene Ursachen in Betracht. Generell sollten Reinigungsmittel im Innenraum von Humidoren nur im Not fall verwendet werden. Besser ist es den Humidor mit hochprozentigem Alkohol auswischen (Alkohol ist zwar kein Fungizid, sondern nur ein Fungistatikum, ist aber in diesem Fall immer noch besser als Reinigungsmittel, die Chlor enthalten können) und danach den Humidor heiß ausföhnen (Schimmelpilze sterben bei Temperaturen über 50° C).